紫禁城如此之大，紫禁城里的主子们数量如此之多，打理起来可是不易，这需要大量的仆役，以供差使。俗话说：“人多的地方是非多。”此话不假，数量众多的宦官集中在一起，出现的是非一定不会少，如果不加以管理，事情难免会向着失控的方向发展。那么，究竟有没有专门的机构组织和管理宦官们呢？紫禁城里，宦官可是为数不少的一个群体，为了能够更好的管理和约束这群人，明清两代都设置了专门的机构。
明代专门的宦官机构统称为内府衙门，因包括十二监、四司和八局，故通常称为二十四衙门，职能是管理内廷各种生活事务。
其中，十二监包括：司礼监，御马监，内官监，司设监，御用监，神宫监，尚膳监，尚宝监，印绶监，直殿监，尚衣监，都知监。根据明太祖朱元璋洪武元年规制，十二监每监设太监一员，正四品，左、右少监各一员，从四品，左、右监丞各一员，正五品，典簿一员，正六品，长随、奉御无定员，从六品，此后历代有修改。
四司包括：惜薪司，钟鼓司，宝钞司，混堂司。旧制每司各司正一人，正五品；左、右司副各一人，从五品，后渐更易。
八局包括：兵仗局，银作局，浣衣局，巾帽局，针工局，内织染局，酒醋面局，司苑局。旧制每局大使一人，正五品；左、右副使各一人，从五品。
二十四衙门，每个衙署都有各自的职责，涵盖了内廷事务的各个方面。
司礼监的主要职权为：
1. 批答奏章，传宣谕旨；
2. 总管所有宦官事务。司礼监不仅在各宦官机构中处于“第一署”的地位，而且实际上也居于总管、统领其他宦官机构的地位。司礼监总管大太监为所有宦官的首领；
3. 兼顾其他重要官职。如南京守备，或专由司礼兼领，或为司礼外差。司礼监总管大太监兼任东厂提督一职。
御马监：管理御用兵符；
内官监：主要掌管采办皇帝所用的器物，如围屏、床榻、桌柜等；
司设监：掌管卥簿、仪仗、围幙、帐幔、雨具等；
御用监：掌办御前所用之物；
神宫监：掌管太庙及各庙的洒扫及香灯等；
尚膳监：掌管御膳、宫内食用和筵宴等；
尚宝监：掌管宝玺、敕符、将军印信；
印绶监：掌管古今通集库以及铁券、诰敕、贴黄、印信、图书、勘合、符验、信符等；
直殿监：掌管各殿及廊庑洒扫之事；
尚衣监：掌管皇帝的冠冕、袍服、靴袜等；
都知监：起初负责各监行移、关知、勘合等事，后来专门跟随皇帝，负责导引清道。
八局包括：
兵仗局：掌造军器，包括刀枪、剑戟、鞭斧、盔甲、弓矢等各类兵器；
银作局：负责打造金银器饰；
浣衣局：该局是二十四衙门中唯一不在皇宫中的宦官机构，局址在德胜门以西，由年老及有罪退废的宫人充任；
巾帽局：掌管宫中内使帽靴、驸马冠靴及藩王之国诸旗尉帽靴；
针工局：负责制作宫中衣服；
内织染局：职掌染造御用及宫内应用缎匹绢帛之事；
酒醋面局：掌管宫内食用酒、醋、糖、浆、面、豆等物；
司苑局：掌管宫中各处蔬菜瓜果及种艺之事。
四司包括：
惜薪司：掌管宫中所用柴炭和二十四衙门、山陵等处内臣柴炭等；
钟鼓司：掌管皇帝上朝时鸣钟击鼓以及演出内乐、传奇、过锦、打稻等杂戏；
宝钞司：掌管造办粗细草纸；
混堂司：掌管沐浴之事。
在二十四衙门中，以司礼监最为重要，是整个宦官系统中最高的权力机构，号称“无宰相之名、有宰相之实”。明代宦官有一系列的管理制度，包括选用制度、管束制度、奖赏制度、病老丧葬制度等，起初，这些职能还是分散在外朝各部手中，但随着内廷司礼监地位的逐渐抬升，其职能的范围也越发扩大，并渐渐将关乎宦官的职能回收，从而所有的宦官都要瘦司礼监的约束和管制。关于宦官的管理，宦官机构自己就已经有了相当的决定权。
清代专门的宦官机构为内务府，直属机构有七司三院，另有其他附属机构，主管皇室衣、食、住、行等各个方面。内务府最高长官为总管内务府大臣，初为三品衙门，雍正十三年(1735)升为正二品，由皇帝从满洲王公、内大臣、尚书、侍郎中特简，或从满洲侍卫、本府郎中、三院卿中升补。关于七司三院的机构职能，本书其他篇章已有记载，此处不再赘述。虽然有内务府，但数量庞大的太监群体处于散漫无组织状态。康熙年间，为了加强对太监的管理，防止太监干预政事，在内务府中增设了专门管理宫中太监的敬事房。
清宫敬事房又称宫殿监办事处，是内务府所属的专门管理宫内太监的机构，其地址先是在乾清官院内的酉甫角，嘉庆以后移到乾东五所原来皇子的居住地。敬事房主要负责管理宫中各处太监的甄别、调补、赏罚等事，也办理宫内的其他事务，包括收取外库钱粮和各种礼仪的筹备。首领太监、笔帖式及一部分太监则专门承应办理内务府的来往文件、夜间坐更、巡防等事。此外敬事房还要记录各皇子、公主的出生情况，后妃之父的姓名、官位及皇帝和后妃的死亡情况，以备纂修玉牒用。最初的敬事房只设置总管、副总管、首领太监、笔帖式、太监等，没有明确其品级。康熙时，明确设五品总管1人，五品太监3人，六品太监2人。雍正元（1723）年改太监总管为四品，副总管为六品，太监首领为七品、八品。雍正四年又规定了敬事房太监的官衔，其正四品总管为宫殿监督领侍衔，从四品总管为宫殿监正侍衔，六品副总管为宫殿监副侍衔，七品首领为执守侍衔，八晶首领为侍监衔。至乾隆七（1742）年，又重新规定以后太监官职不得超过四品。