北元与明朝的对立，一般认为持续到公元1388年，这一年，蓝玉在捕鱼儿海大破北元，北元皇帝脱古思帖木儿被阿里不哥的后裔也速迭儿所杀。脱古思帖儿的被杀，在元朝历史上可能比元顺帝北逃更有象征意义，从此忽必烈子孙世袭蒙古大汗的传统中断，当年败于忽必烈之手的阿里不哥后裔夺取大汗之位。与忽必烈的后裔长期生活在中原不同，阿里不哥的后裔世代生活在蒙古草原，从也速迭儿开始，蒙古大汗再无年号和庙号，北元彻底消失。

　　虽然两者都属于蒙古，但之所以会形成这样的局面，骨子里还是因为瓦剌和鞑靼从本质上存在区别。鞑靼是蒙古传统的游牧民族，活动范围基本也都在成吉思汗起势的蒙古高原，实际上也就是蒙古的祖庭所在，如今的内、外蒙古地区。但是瓦剌可不一样，他们的祖先并不是纯正的蒙古人，他们是被蒙古人征服的草原森林部落，也就是狩猎民族，而且活动范围多在叶尼塞河流域上游。

　　鞑靼在明帝国的高压打击下，势力极具衰落，这时候西部的瓦剌在脱欢的领导下强势崛起，脱欢于其子也先两代瓦剌太师趁鞑靼衰落之时，不断挥师东征，在几年以内不仅击杀了阿鲁台攻占了鞑靼的大部分领土还曾一度打到明东北区域的朵颜三位，一时间实力达到鼎盛，而此时的鞑靼已经没有任何实力与瓦剌抗衡了，而随着明成祖朱棣的去世，明代后继的皇帝也无力对瓦剌进行大规模的军事打击。

　　为争夺蒙古汗位，瓦剌与鞑靼部频繁争战，势力各有消长。 [战争 八年，明成祖北征，鞑靼势衰，瓦剌乘机南下。可以说瓦刺的强大跟明朝有直接作用，养虎为患。